Mange farmaceutiske proteiner (lægemiddel-relevante proteiner) udtrykkes på uopløselig form i E. coli som såkaldte ”inclusion bodies”. Dette sker fordi de på den ene eller anden måde er giftige for bakterierne eller bakterierne ikke besidder de nødvendige hjælpeproteiner eller betingelser for korrekt foldning til opløselige aktive proteiner. Lave refoldningsudbytter gør, at proteinerne til farmaceutisk brug skal produceres i meget store anlæg, ofte på flere tusinde liter, hvilket er meget omkostningstungt for den farmaceutiske industri.